Першим проектом, який реалізував Центр «Ейдос», стала серія з 12 семінарів «Як налагодити ефективну діяльність регіональним НУО». Перші з них були організовані ще до офіційної реєстрації, решта – протягом 2007-2008 років. Лекторами на цих семінарах виступали представники найпотужніших на той час громадських організацій. 420 чоловік, які взяли участь у тренінгах у 12 областях стали першими, хто відвідав навчальні заходи «Ейдосу».

У 2008-2009 роках Центр організував серію з 8 семінарів на тему міфів співпраці України та НАТО та 8 семінарів з розробки та реалізації регіональної політики. У 2010 з'явилася вже згадана Вища Політична Школа, а з 2011 року, коли Центр перейшов з навчальної до моніторингової, адвокаційної та антикорупційної діяльності, навчальні програми часто ставали складовими більших проектів.

У 2012 році, перед парламентськими виборами, Центр проводив також серію заходів, присвячених протидії маніпуляціям під час виборчого процесу та технікам, які можуть допомогти звичайним громадянам боротися з аткими маніпуляціями.

У 2010-2013 роках у лініційці навчальних програм «Ейдосу» додалися численні тренінги та семінари з протидії корупції, моніторингу державних закупівель, доступу до публічної інформації. Пізніше додалися навчальні програми з використання таких інструментів як портал публічних фінансів e-data, Prozorro, системи «Відкритий Бюджет», проведення журналістських розслідувань за допомогою відкритих реєстрів тощо. Першим в Україні Центр почав проводити навчання з виявлення корупції у фінансових звітах політичних партій, по протидії конфлікту інтересів у органах місцевого самоврядування, запровадженню етичних кодексів у органах влади тощо. Усі ці навчальні програми є складовими більших проектів.

Навчених активістів та експертів ми часто залучаємо в якості волонтерів та регіональних партнерів в рамках проектної діяльності. У багатьох випадках тренінги Центру ставали для активістів відправною точкою для того, щоб піти в політику або перейти на роботу в неурядові організації.

Ми віримо, що часто причиною провалу реформ, особливо на місцевому рівні, є не свідомий саботаж, а відсутність необхідних знань серед чиновників. Тому багато з наших програм спрямовані саме на них.

Хоча серед навчальних програм Центру превалюють тренінги, спрямовані на прищеплення практичних навичок, ми продовжуємо створювати і нові свтоглядні програми. Так у 2016 році була запущена серія семінарів «Економічний вимір прийняття політичних рішень», що покликаний прояснити активістам вплив економіки на політику в реаліях України. Спільно з Малою академією наук був запущений проект для школярів «Агенти змін», який направлений на світоглядний розвиток найбільш здібних школярів України.